Jejím cílem je posílit a sjednotit digitální transformaci veřejné správy, zlepšit poskytované služby občanům či posunout digitální úroveň jak u nás, tak i v rámci Evropy. Agentura se věnuje projektům jako jsou eDoklady, Portál občana, Datové schránky, kontaktním místům CzechPOINT, Základním registrům či koordinuje naplňování zákona o právu na digitální služby.